Pozice: Vědecký pracovník
Oddělení: Oddělení adaptivních biotechnologií
Pracoviště: ÚVGZ AV ČR, v. v. i. Drásov 470 Drásov 664 24
Email: zavrel.t@czechglobe.cz
Odborné zaměření
Biotechnologie řas a sinic, optimalize bio-produkce, alokace zdrojů, fotosyntéza, stresová fyzilologie, systémová biologie
Vzdělání
2015: Ph.D., Fyziologie rostlin, Masarykova Univerzita, Brno, Česká republika
2011: Mgr., Fyziologie rostlin, Masarykova Univerzita, Brno, Česká republika
Profesní kariéra
2020-dosud: Vědecký asistent, Ústav Výzkumu Globální Změny AV ČR, v. v. i., Drásov
2015-2019: Postdoktorant, Ústav Výzkumu Globální Změny AV ČR, v. v. i., Drásov
2011-2015: Doktorand, Centrum Výzkumu Globální Změny AV ČR, v. v. i., Drásov
2012-2014: Pracovník výzkumu a vývoje, Photon System Instruments, spol. s r. o., Drásov
Významné výzkumné pobyty a stipendia
2018-2024, opakované stáže: Department of Hydrobotany, Balaton Limnological Institute, Tihany, Hungary
2018/10: Alexander Silberman Institute of Life Sciences, Hebrew University of Jerusalem, Jerusalem, Israel
2016/10-11: Climate Change Cluster (C3), University of Technology Sydney, Sydney, Australia
2013/04-05: Bioenergy Group, Center for Biotechnology, University of Turku, Turku, Finland
2011/06-08: Department of Biology, Washington University in St. Louis, St. Louis, USA
Členství
Česká Společnost Experimentální Biologie Rostlin
Biotechnologická Společnost
Stručná scientometrie
Všechny publikace (Google Scholar)
Höper R., Komkova D., Zavřel T., Steuer R. (2024) A quantitative description of light-limited cyanobacterial growth using flux balance analysis. PLoS Comput Biol 20(8): e1012280. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1012280
Zavřel T., Segečová A., Kovács L., Lukeš M., Novák Z., Pohland A-Ch., Szabó M., Somogyi B., Prášil O., Červený J., Bernát G., A Comprehensive Study of Light Quality Acclimation in Synechocystis Sp. PCC 6803, Plant and Cell Physiology, 2024;, pcae062, https://doi.org/10.1093/pcp/pcae062
Espinoza-Corral R., Iwai M., Zavřel T., Lechno‐Yossef S., Sutter M., Červený J., Niyogi K. K., Kerfeld C. (2023): Phycobilisome protein ApcG interacts with photosystem II and regulates energy transfer in Synechocystis. Plant Physiology, kiad615, https://doi.org/10.1093/plphys/kiad615
Rodrigues J.S., Kovács L., Lukeš M., Hoeper R., Steuer R., Červený J., Lindberg P., Zavřel T. (2023) Characterizing isoprene production in cyanobacteria– insights into the effects of light, temperature, and isoprene on Synechocystis sp. PCC 6803. Bioresource Technology, 380, 129068, https://doi.org/10.1016/j.biortech.2023.129068
Sukačová K., Szotkowski M., Pařil P., Mareš J., Touš M., Vícha D., Polášek M., Márová I., Zavřel T. (2023) Simultaneous production of γ-linolenic acid and carotenoids by a novel microalgal strain isolated from the underexplored habitat of intermittent streams. Algal Research, 71, 103055, https://doi.org/10.1016/j.algal.2023.103055
Inomura, K., Masuda, T., Eichner, M., Rabouille, S., Zavřel, T., Červený, J., Vancová, M., Bernát, G., Armin, G., Claquin, P., Kotabová, E., Stephan, S., Suggett, D. J., Deutsch, C., & Prášil, O. (2021). Quantifying Cyanothece growth under DIC limitation. Comp. Struct. Biotech. J., 19, 6456–6464. https://doi.org/10.1016/j.csbj.2021.11.036
Polerecky L., Eichner M., Masuda T., Zavřel T., Rabouille S., Campbell D.A. and Halsey K. (2021) Calculation and Interpretation of Substrate Assimilation Rates in Microbial Cells Based on Isotopic Composition Data Obtained by nanoSIMS. Front. Microbiol. 12:621634. https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.621634
Zavřel T., Schoffman H., Lukeš M., Fedorko J., Keren N, Červený J. (2021) Monitoring fitness and productivity in cyanobacteria batch cultures. Algal Research. 56: 1-15. https://doi.org/10.1016/j.algal.2021.102328
Rabouille S. et al. (2021): Electron & Biomass Dynamics of Cyanothece Under Interacting Nitrogen & Carbon Limitations. Front. Microbiol. 12: 1-21. https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.617802
Bernát, G., Zavřel, T., Kotabová, E., Kovács, L., Steinbach, G., Vörös, L., Prášil, O., Somogyi, B. and Tóth, V. R. (2021) Photomorphogenesis in the Picocyanobacterium Cyanobium gracile Includes Increased Phycobilisome Abundance Under Blue Light, Phycobilisome Decoupling Under Near Far-Red Light, and Wavelength-Specific Photoprotective Strategies. Front. Plant Sci. 12: 1-16. https://doi.org/10.3389/fpls.2021.612302
Sukačová K., Lošák P., Brummer V., Máša V., Vícha D.and Zavřel T. (2021) Perspective Design of Algae Photobioreactor for Greenhouses—A Comparative Study. Energies 14(5), 1338. https://doi.org/10.3390/en14051338
Polerecky L. et al. (2021): Temporal Patterns and Intra- and Inter-Cellular Variability in Carbon and Nitrogen Assimilation by the Unicellular Cyanobacterium Cyanothece sp. ATCC 51142. Front. Microbiol. 12: 1-15 https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.620915
Müller S, Zavřel T, Červený J. (2019): Towards a quantitative assessment of inorganic carbon cycling in photosynthetic microorganisms. Eng Life Sci. 1–13. https://doi.org/10.1002/elsc.201900061
Zavřel, T., Faizi, M., Loureiro, C. Poschmann, G. Stühler, K. Sinetova, M. A. Zorina, A. Steuer, R. Červený, J. (2019): Quantitative insights into the cyanobacterial cell economy. eLife (8): 1-29, e42508. 10.7554/eLife.42508
Zavřel T., Chmelík D, Sinetova MA, Červený J. (2018): Spectrophotometric Determination of Phycobiliprotein Content in Cyanobacterium Synechocystis. Journal of Visualized Experiments. 2018; (139):1 – 9. 10.3791/58076
Zavřel T., Szabó M., Tamburic B., Evenhuis Ch., Kuzhiumparambil U., Literáková P., Larkum A. W. D., Raven J. A., Červený J., Ralph, P. J. (2018): Effect of carbon limitation on photosynthetic electron transport in Nannochloropsis oculata. Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology. 18: 31-43. 10.1016/j.jphotobiol.2018.02.020
Faizi, M., Zavřel, T., Loureiro, C., Červený, J., Steuer, R. (2018): A model of optimal protein allocation during phototrophic growth. Biosystems. 10.1016/j.biosystems.2018.02.004
Zavřel, T., Očenášová, P., Sinetová, M. A., Červený, J. (2018): Determination of Storage (Starch/Glycogen) and Total Saccharides Content in Algae and Cyanobacteria by a Phenol-Sulfuric Acid Method. Bio-protocol 8(15). 10.21769/BioProtoc.2966
Zavřel T., Očenášová P., Červený J. (2017): Phenotypic characterization of Synechocystis sp. PCC 6803 substrains reveals differences in sensitivity to abiotic stress. PLoS ONE (12): 1-21.: 10.1371/journal.pone.0189130
Zavřel T., Červený J., Knop H., Steuer R. (2016): Optimizing cyanobacterial product synthesis: Meeting the challenges. Bioengineered. https://doi.org/10.1080/21655979.2016.1207017
Zavřel T, Knoop H, Steuer R, Jones PR, Červený J, Trtílek M. (2016): A quantitative evaluation of ethylene production in the recombinant cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 harboring the ethylene-forming enzyme by membrane inlet mass spectrometry. Bioresource Technology. 10.1016/j.biortech.2015.11.062
Červený J., Sinetova M. A., Zavřel T., Los D. A. (2015) Mechanisms of High Temperature Resistance of Synechocystis sp. PCC 6803: An Impact of Histidine Kinase 34. Life 5: 676-699. DOI:10.3390/life5010676
Zavřel T., Sinetova M. a., Búzová D., Literáková P. Červený J. (2015) Characterization of a model cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 autotrophic growth in a flat-panel photobioreactor. Engineering in Life Sciences. 15: 122-132. https://doi.org/10.1002/elsc.201300165
Zavřel T., Sinetová, M. A., Červený, J. (2015): Measurement of chlorophyll a and carotenoids concentration in cyanobacteria. Bio-protocol 5(9). 10.21769/BioProtoc.1467
Sinetova M. A., Červený J., Zavřel T., Nedbal L (2012) On the dynamics and constraints of batch culture growth of the cyanobacterium Cyanothece sp. ATCC 51142. Journal of Biotechnology 162:148-155. https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2012.04.009
