Ing. Jan Červený, Ph.D.

Pozice: Koordinátor výzkumné sekce, vedoucí oddělení

Oddělení: Oddělení adaptivních biotechnologií

Oddělení: Oddělení chytrých biotechnologií

Pracoviště:
ÚVGZ AV ČR, v. v. i.

Bělidla 4a

Brno

603 00

Email: cerveny.j@czechglobe.cz

Telefon: 775171968

Odborné zaměření

kybernetika; optimalizace procesů; systémová biologie; experimentální biologie; umělá inteligence; strojové učení; biologické rytmy; mikrořasové biotechnologie; vývoj bioaplikací; selekční výběr/šlechtění mikrořas; matematické modelovéní;

Vývoj metod pro charakterizaci a efektivní optimalizaci produkčních a adaptivních vlastností fotosyntetických mikroorganismů

Vývoj referenční experimentální platformy pro validační experimenty

Vývoj a návrh technologických řešení pro viabilní řasové biotechnologie

Vývoj výpočetní platformy pro prediktivní (in silico) experimenty (http://www.e-cyanobacterium.org/, http://www.e-photosynthesis.org)

Matematické modelování a identifikace oscilačních mechanismů u řas a sinic v širokém spektru kultivačních podmínek

Vysokokapacitní fluorescenční mikroskopické analýza fotosyntetických mikroorganismů na jednobuněčné úrovni

Třídění směsných populací a selekce podpopulací s vybranými vlastnostmi

Šlechtění vybraných druhů mikroorganismů

Vzdělání

2011: Ph.D. z Technické kybernetiky, studijní obor Teorie řízení a systémové inženýrství, České vysoké učení technické v Praze (téma Matematické modely v řasových biotechnologiích, školitel prof. P. Zítek)

2004: Ing. z Přístrojové a řídící techniky na Oddělení automatického řízení, České vysoké učení technické v Praze

Profesní kariéra

2015 : Vedoucí výzkumné sekce, Sekce adaptivních a inovačních technik, Ústav výzkumu globání změny AV ČR, v.v.i., Drásov

2013 : Vedoucí oddělení, Oddělení adaptivních biotechnologií, Centrum výzkumu globání změny AV ČR, v.v.i., Drásov

2010 – 2013: Vedoucí skupiny, Laboratoř fyziologie a biotechnologie, Ústav systémové biologie a ekologie, v.v.i, Nové Hrady

2009 – 2012: R&D a vědecký poradce, Photon Systems Instruments, spol. s r.o., Drásov

2005 – 2010: Vědecký pracovník, Ústav systémové biologie a ekologie AV ČR, v.v.i, Nové Hrady

2004 – 2007: Asistent výzkumu a vzdělávání, Ústav přístrojové a řídicí techniky, České vysoké učení technické v Praze, Praha

2002 – 2007: Vědecký pracovník, Centrum aplikované kybernetiky, Praha

Významné výzkumné pobyty a stipendia

2019 (3 měsíce): Honorary Appointment Fellow na Climate Change Cluster, University of Technology Sydney, Sydney, Australia (Prof. Peter Ralph)

2010 (7 měsíců): Research Associate na Department of Chemistry and Biochemistry, University of California Los Angeles, Los Angeles, USA (Prof. Sabeeha S. Merchant)

2008 (1 měsíc): Visiting Scientist na Department of Biology, Washington University in St. Louis, St. Louis, USA (Prof. Himadri B. Pakrasi)

Členství

Člen Rady instituce Ústavu výzkumu globání změny AV ČR, v.v.i.

Předseda Kolegia ředitele Ústavu výzkumu globání změny AV ČR, v.v.i.

Člen Kolegia pro inovace a transfer znalostí AV ČR

Člen poradního panelu MathWorks

Člen pracovní skupiny CzechGlobe-HRS4R/HR Excellence in Research Award

Člen řídicí rady ESFRI Centra pro systémovou biologii – C4Sys

Člen editorského panelu, Scientific Reports

Člen editorského panelu, Frontiers in Photobiology

Člen recenzního panelu žurnálů Nature Communications, Mayo Clinic: Digital Health, PLOS ONE, Engineering in Life Sciences, Bioresource Technology, Plant and Cell Physiology, Algal Research, Photosynthetica, Journal of Advanced Research, BioProtocols

Člen Society for Experimental Biology

Mentor mladých vědců pro Frontiers Young Minds