Pozice: Vedoucí oddělení, vědecký pracovník
Oddělení: Oddělení ekosystémové výměny stopových plynů
Pracoviště: ÚVGZ AV ČR, v. v. i. Bělidla 4a Brno 603 00
Email: machacova.k@czechglobe.cz
Telefon: 511192224
Odborné zaměření
Rostlinná fyziologie a ekologie se zaměřením na studium toků oxidu dusného a metanu z různých druhů stromů, z půdy a z lesních ekosystémů
Vzdělání
Doktorské studium:
10/2008 – 06/2012 Albert-Ludwigs-Universität Freiburg,Německo, Faculty of Forest and Environmental Sciences, Chair of Tree Physiology
specializace: fyziologie stromů
Doktorské práce: „Emise oxidu dusného (N20) a metanu (CH4) z kmenů různých druhů stromů“
10/2008 – 06/2012 doktorandská škola „Environment, Society and Global Change“, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, Německo, vědní oblast “Adapting Forest Ecosystems to Global Change”
Magisterské studium:
09/2002 – 06/2008 Univerzita Karlova v Praze, Přírodovědecká fakulta
studijní program: biologie, specializace: rostlinná fyziologie (Katedra experimentální biologie rostlin)
Magisterská práce: „Změny struktury mikrotubulárního cytoskeletu během zakládání Casparyho proužku v endodermálních buňkách kořene Allium cepa“
10/2005-09/2006 Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, Německo, Faculty of Biology
Profesní kariéra
Od 1.5.2018 vedoucí oddělení a vědecký pracovník v Oddělení ekosystémové výměny stopových plynů, Ústav výzkumu globální změny, Akademie věd České republiky, v. v. i.
01.01. – 31.10.2021 docent v Chair of Physical Geography and Landscape Ecology, Department of Geography, University of Tartu, Estonsko
01.11. – 31.12.2020 senior vědec v Chair of Physical Geography and Landscape Ecology, Department of Geography, University of Tartu, Estonsko
01.11.2012 – 30.4.2018 vědecký pracovník (Post Doc pozice) v Laboratoři ekologické fyziologie rostlin, Ústav výzkumu globální změny, Akademie věd České republiky, v. v. i.
Ocenění
06/1998 bronzová medaile z INEPO (International Environmental Project Olympiad) v Istanbulu, Turecko
Významné výzkumné pobyty a stipendia
11/2019 – 06/2021 projekt „FOREST-AGRICULTURE-WATER NEXUS: Bilateral Workshops for Supporting Tools for Ecosystem Services Governance“, Bilaterální fond Programu „Životní prostředí, ekosystémy a změna klimatu“ – Norské granty, KM řešitel za CzechGlobe
2017 – 2019 projekt „Toky metanu a oxidu dusného z různých druhů stromů temperátního a boreálního lesa“, Juniorský projekt GAČR (17-18112Y), KM hlavním řešitelem
09/2019 výzkumný pobyt v tropickém deštném lese na experimentální stanici Quistococha, Iquitos, Amazonia, Peru
05/2019 – 07/2019 výzkumný pobyt na experimentální stanici Kranzberger Forst, Freising, Německo
10/2018 – 11/2018 výzkumný pobyt v tropickém deštném lese (exp. stanice Mare Longue Nature Reserve) na ostrově La Reunion, Francie, kooperace s University of Reunion Island (Multi-domain Access to RI platforms funding under ENVRIplus project, Horizon 2020)
2015 – 2016 projekt „Emise metanu (CH4) a oxidu dusného (N2O) ze stromů Fagus
sylvatica“ v rámci Program of Project Based Personnel Exchange: DAAD a AVČR (DAAD-15-03), KM český řešitel
06/2017 – 07/2017 výzkumný pobyt na experimentální stanici v Hyytiala, Finsko, kooperace s University of Helsinki
06/2015 – 07/2015 výzkumný pobyt na experimentální stanici Konventwald, Black forest, a na Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, Německo, kooperace s Albert-Ludwigs-Universität Freiburg (projekt v rámci Program of Project Based Personnel Exchange: DAAD a AVČR)
04/2015 – 06/2015 výzkumný pobyt na experimentální stanici v Hyytiala, Finsko, kooperace s University of Helsinki
02/2015 – 03/2015 výzkumný pobyt na experimentální stanici v Hyytiala, Finsko, kooperace s University of Helsinki (transnational access funding under the ExpeER (Ecosystem research) project, EU FP7)
10/2014 – 11/2014 výzkumný pobyt na experimentální stanici v Hyytiala, Finsko, kooperace s University of Helsinki (transnational access funding under the ExpeER (Ecosystem research) project, EU FP7)
04/2014 – 07/2014 výzkumný pobyt na experimentální stanici v Hyytiala, Finsko, kooperace s University of Helsinki (transnational access funding under the ExpeER (Ecosystem research) project, EU FP7)
05/2013 – 08/2013 výzkumný pobyt na experimentální stanici v Hyytiala, Finsko, kooperace s University of Helsinki (transnational access funding under the ExpeER (Ecosystem research) project, EU FP7)
10/2011 – 02/2012 stipendium pro doktorské studium na Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, Německo, od Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
10/2008 – 09/2011 stipendium pro doktorské studium na Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, Německo, od German Academic Exchange Service (DAAD)
12/2009 – 01/2010 výzkumný pobyt na Institute of Meteorology and Climate Research, Karlsruhe Institute of Technology, Garmisch-Partenkirchen, Německo
10/2005 – 07/2006 stipendium pro studium biologie na Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, Německo, od nadace Landesstiftung Baden-Württemberg
Členství
European Geosciences Union (EGU) membership
American Geophysical Union (AGU) membership
od roku 2016 pravidelná organizace a spoluorganizace sekcí na téma „Forests and the methane (CH4) and nitrous oxide (N2O) cycles“ a „Gas exchange between soil, plants and atmosphere“ v rámci každoroční EGU General Assembly konference (Vídeň, Rakousko)
Stručná scientometrie
Počet peer-reviewed článků: 20
Počet článků v jiných časopisech/sbornících: 8
Počet kapitol v knihách: 2
Počet konferenčních příspěvků: 73
Celkový citační index: 311
h-index: 10
ResearcherID: G-1603-2014
ORCID: 0000-0002-8289-169X
Nejdůležitější publikace:
Machacova K, Borak L, Agyei T, Schindler T, Soosaar K, Mander Ü, Ah-Peng C (2021) Trees as net sinks for methane (CH4) and nitrous oxide (N2O) in the lowland tropical rain forest on volcanic Réunion Island. New Phytologist 229: 1983–1994, DOI:10.1111/nph.17002.
Mander Ü, Krasnova A, Escuer-Gatius J, Espenberg M, Schindler T, Machacova K, Pärn J, Maddison M, Megonigal JP, Pihlatie M, Kasak K, Niinemets Ü, Junninen H, Soosaar K (2021) Forest canopy mitigates soil N2O emission during hot moments. npj Climate and Atmospheric Science 4: 39. https://doi.org/10.1038/s41612-021-00194-7.
Moldaschl E, Kitzler B, Machacova K, Schindler T, Schindlbacher A (2021) Stem CH4 and N2O fluxes of Fraxinus excelsior and Populus alba trees along a flooding gradient. Plant and Soil 461: 407–420. https://doi.org/10.1007/s11104-020-04818-4.
Schindler T, Mander Ü, Machacova K, Espenberg M, Krasnov D, Escuer-Gatius J, Veber G, Pärn J, Soosaar K (2020) Short-term flooding increases CH4 and N2O emissions from trees in a riparian forest soil-stem continuum. Scientific Reports 10: 3204, 10.1038/s41598-020-60058-7.
Machacova K, Vainio E, Urban O, Pihlatie M (2019) Seasonal dynamics of stem N2O exchange follow the physiological activity of boreal trees. Nature Communications 10: 4989, DOI: 10.1038/s41467-019-12976-y.
Maier M, Machacova K, Svobodova K, Urban O, Lang F (2018) Combining soil and tree-stem flux measurements and soil gas profiles to understand CH4 pathways in Fagus sylvatica forests. Journal of Plant Nutrition and Soil Science 181: 31–35, DOI: 10.1002/jpln.201600405.
Machacova K, Maier M, Svobodova K, Lang F, Urban O (2017) Cryptogamic stem covers may contribute to nitrous oxide consumption by mature beech trees. Scientific Reports 7: 13243, DOI: 10.1038/s41598-017-13781-7.
Machacova K, Bäck J, Vanhatalo A, Halmeenmäki E, Kolari P, Mammarella I, Pumpanen J, Acosta M, Urban O, Pihlatie M (2016) Pinus sylvestris as a missing source of nitrous oxide and methane in boreal forest. Scientific Reports 6, 23410, DOI: 10.1038/srep23410.
