Volně cirkulující histonové komplexy jako diagnostický nástroj dětských nádorových onemocnění centrálního nervového systému (CNS).
Koordinující příjemce: Fakultní nemocnice u sv. Anny ICRC
Další účastník projektu: Ústav výzkumu globální změny AV ČR, v. v. i.
Klíčová slova: rakovina, meduloblastom, histony, ependymom, DIPG, cirkulující, volně, nukloezomy, high grade gliom
Anotace projektu:
V tomto projektovém návrhu bychom se chtěli zaměřit na studium „tekutých biopsií“ jako nového a méně invazivního nástroje pro diagnostiku rakoviny. Naším cílem je získat hluboké porozumění o variabilitě a kombinacích volných cirkulujících histonů a jejich komplexů u různých PBT, a zda mohou tyto nálezy poskytnout dostatečnou specificitu pro klinickou diagnostiku dětských CNS nádorů. Cíl 1. Diagnostické a prognostické hodnoty cirkulujících histonů v krvi dětí postižených meduloblastomem, difuzním intrinsickým pontinním gliomem (DIPG), neuroblastomem a ependymomem. Pomocí systému průtokové mikroskopie ImageStreamX bychom rádi provedli screening vzorků „bio-tekutin“ (krve a mozkomíšního moku – CSF) pacientů s PBT na přítomnost volných cirkulujících histonů a jejich komplexů, které by mohly mít významnou diagnostickou hodnotu, jež může být uplatnitelná v klinické praxi. Cíl 2. Mechanismy uvolňování histonů do extracelulárního prostředí V rámci tohoto cíle plánujeme odhalit domnělé buněčné mechanismy, kterými se histony a jejich komplexy uvolňují z buněk do extracelulárního prostředí. Konkrétně chceme tuto problematiku studovat v buněčných systémech in vitro pomocí měření hladiny exprese chaperonových enzyme. Zároveň plánujeme užití technologii siRNA k narušení/snížení regulace jednotlivých chaperonů a podle toho zjistíme, zda tyto přístupy změnily příslušný sekretovaný profil extracelulárních histonů.